d13日4时，明智军山之手先锋并河、松田队与天王山麓中的中川队交锋，战斗开始。
中央的高山队受到明智军斋藤、阿闭队的猛攻，高山队被逼入穷境。
幸得中川、堀队从左翼、池田队从右翼夹击，逼退斋藤、阿闭队。
此时，羽柴秀长队击破明智军山之手并河队。
明智军予备队伊势、藤田队从右翼，津田、村上队从左翼夹击羽柴军。两军一直处于一进一退的攻防状态。
战斗的中心是围绕着抢占战场上的高地，两军的军旗在山麓上相互纠缠，战况相当激烈。
然而，随着秀吉的后备部队不断加入战斗，两军的战斗力开始发生变化。
最后由于属于羽柴军的池田恒兴偷袭明智军的津田信春，使得羽柴军成功包围明智军。午后7时，明智军崩溃，光秀下令撤退。自己引败兵700余人逃入胜龙寺城。
然后秀吉采纳了大谷吉继的进言，闪开北面城门，全力攻打其它三面。士气涣散的城内士兵纷纷从北面开城逃去，连光秀也无法阻止。为了谋图东山再起，光秀和少数近臣离开胜龙寺城，逃往坂本城。
在京都山科小栗栖，明智光秀遇上一群拦路的忍者。
第四二九章决定天下的大战
明智光秀大惊，他身边只有寥寥无几的几个人，而对面却是数十名忍者。
他艰难地咽下一口唾沫，颤抖地问道：“你们是谁的忍者众”
带头的忍者明显笑了，他说道：“惟任日向守大人，何必装傻呢啊，在下的名字就不需要给你说名字了，市姬夫人希望将军殿下拿下日向守大人的首级，祭奠织田太阁大人的亡魂。”
明智光秀暴怒道：“浑蛋，武田正信过河拆桥是他怂恿我的，你这是来杀人灭口啊”
忍者头领冷哼一声，喝道：“上”
明智光秀不过几个人，难以抵挡，很快就被杀戮干净，只留下一个明智光秀。
明智光秀一脸含恨地看着对面的忍者：“我要切腹自尽”
忍者头领手一挥，忍着们迅速拉起了白色的帷幕，明智光秀也换上了白色的武士服，在一片绝望之中自杀了。
忍者头领割下了明智光秀的首级，迅速清理了一番，随后就离开了。
山崎之战后，织田家的主要几个重臣都回到了织田家的清洲城，作为织田家继承人的织田信忠也死在了京都。
没了织田信忠，谁也无法阻止织田氏内部出现派系分裂。主要分裂为柴田胜家、织田信雄、织田信孝以及羽柴秀吉等派系。
同年的清洲会议上，取得织田多数旧臣支持，但与柴田胜家开始敌对。
同年，羽柴秀吉、柴田胜家、丹羽长秀、池田恒兴四人在清洲城开会商议织田的继承问题，结果丰臣秀吉在得到丹羽长秀、池田恒兴支持的情况下压制了胜家实际成为织田家的掌权人。
羽柴秀吉在清洲会议上得到多数织田族人与家臣支持，拥立尚在襁褓的织田信忠长男三法师元服后称织田秀信继任织田氏家督。
但为此得罪了同属织田重臣的柴田胜家，导致其拥立织田信长三子织田信孝对抗丰臣秀吉。
天正十年十二月，秀吉乘北国大雪，胜家难以出兵之机率军由京都出发，降胜家属城近江长滨城。
其后冒风雪进军美浓，围困了信孝的歧阜城，在信孝交出人质后班师。柴田胜家接到近江，美浓的战报后，苦于道路积雪无法派兵支援。
不过，泷川一益于天正十一年正月夺取了伊势龟山，峰等数城，防备秀吉南进，间接声援了信孝。
与此同时，胜家命佐久间盛政发兵近江，领命的盛政等将率军于三月三日由越前北之庄出发，除雪前进，进入近江后，迫近天神山上秀吉方的堡垒，并于木之本附近放火。
之后，二十日，胜家大军到达柳濑布阵，展开对长滨城的诱降。
不久，遭遇秀吉军北进，胜家退至柳濑北面内中尾山，置本营于此。
同时，筑防御工事于周围的橡谷山，林谷山，中谷山，别所山，行市山等地，形成与秀吉对峙之势。
而此前，秀吉率军由美浓入伊势，围峰城，取龟山，夺国府城得报胜家入近江后，留信雄平定伊势，另分兵一路防范信孝，自己则引军北上近江。
三月十七日，占领了贱岳一带的高地，置本阵于木之本，于左弥山，堂木山，神明山及田上山，岩崎山，大岩山，贱岳筑垒，扼守各山路关隘。此外，还请丹羽长秀出兵海津口。
四月五日，胜家率旗本迫近堀秀政的左弥山砦，但因秀政防守严密而退却。
胜家诱敌之计虽不成，倒在十三日成功寝返了堂木山砦柴田胜丰部将山路将监。
正当两军对峙之际，织田信孝于歧阜举兵，袭击了投靠了秀吉的原属下大垣城主氏家直通与清水城主稻叶一铁的领地，与胜家遥相呼应。
羽柴秀吉于是急率旗本离开木之本，于十六日到达大垣城。
羽柴秀吉离开木之本的消息被探知后，胜家决定乘虚发动进攻。
二十日，佐久间盛政于凌晨一时由行市山出发，黎明之际袭击并占领了大岩山砦。随后秀吉方岩崎山一带守军悉数退至木之本。
秀吉在二十日正午时分于大垣得知胜家袭击大岩山的消息后，连忙在下午二时再次急驰江北，晚上九时抵达木之本。
二十一日凌晨二时，登上茶臼山，开始对后退的佐久间军展开追击，追击至贱岳附近，双方军势不断聚集，发生了激烈的战斗。
到八时为止，激战的结果，秀吉方面击退北方军，并于正午乘胜逼近柳濑胜家本营，击溃之并给予北逃之敌以毁灭性的打击，
胜家柳濑败北后，逃回北之庄，笼城待战。秀吉军尾追并于二十三日包围了北之庄。
二十四日上午四时，秀吉命诸队一齐展开攻击，正午攻入本丸，一阵短兵相接后突入天守阁，胜家绝望之后火烧天守，自杀身亡。
羽柴秀吉还没有高兴呢，就有一名百足众快速跑来，冲到羽柴秀吉面前，说道：“启禀殿下，二十里外发现征夷大将军的兵势，有四万人”
羽柴秀吉大惊，蹲到百足众面前，大吼道：“你说什么没有说错吧啊”
百足众摇头道：“殿下，千真万确，是大将军的旗帜”
羽柴秀吉吓得跌倒在地，周边的家臣立刻上前扶住他。
他对左右说道：“诸位，武田正信带着四万人朝这里过来了，该死，之前我们所有的争斗不过是为武田正信做了嫁衣啊