借机得以干涉准噶尔部的内政，僧格由于众兄弟对他统治的激烈反抗，也不得不接受了和硕特部的一再干涉。
因此准噶尔诸部，甚至整个卫拉特联盟（即明朝时所称呼的瓦剌诸部），实力并不强大。
只能说其比东蒙古强大很多，但显然远远不及满洲盛时。
当年和硕特部的一代雄主固始汗，占据青海、康巴全境，入藏推翻了藏巴汗政权，确立新兴教派格鲁派诸领袖在西藏的领导地位，建立了堪称强大的和硕特汗国。
但是明末时，大顺军以青海一带为重要的抗清基地，后来同孙可望争夺关中时，也是以青海、甘肃为主要的出兵基地。
顺军大将米剌印屡屡以西宁为根据地，出兵同青海一带的和硕特部交战，引发了顺朝和和硕特汗国的长期边境争斗。
前期，由于大顺军的主力要应对清军和西明军的大规模战事，无暇他顾，仅仅保有西宁一隅之地而已。
但随着清军完全退出关内，孙可望又连战连败，丧失西南地区以后，顺军对西北边境的捍卫力度就大大提高了。
为了争夺青海和康区，固始汗率领数万精兵出藏击顺，他大举北进，以年迈之躯横扫了归附顺朝的诸台吉，顺利进军至河州、西宁一带，威胁了大顺边境的安定。
在固始汗大军的猛攻下，青海顺军相继溃败，伤亡数千人之多。制将军米剌印闻警后，一面向朝廷汇报消息，一面亲自率领亲军标等精兵三千多人赶赴青海增援。
可是寡不敌众，而且固始汗得到当地喇嘛教僧侣的支持，兵锋大盛。大军所至，远近风靡，游牧番子、喇嘛等二十余万，同时骚动。
蒙古人挑唆远近喇嘛及百姓二十万余万人，掠牛马，烧草谷，抗官兵，犯西宁，青海大乱。
西宁数百里之内，一切有名寺院喇嘛皆披甲执械，率其佃户僧俗人等，攻城打仗，抢掠焚烧，无所不至。
李来亨获悉固始汗侵犯青海，甚至打到甘肃境内的消息后，作了两手布置：一方面令西北经略使周祚鼎办理平叛军务，另一方面派兵政府侍郎曹本荣到固始汗的驻地沙拉图传达朝廷旨意，令其罢兵停战，希望通过和平手段解决问题。
但固始汗不仅拒绝了朝廷的劝谕，反而拘禁使者，并进一步加强了对西宁周围地区的攻势，对西宁府周围的南川申中堡、西川镇海堡与北川新城等地发动了大规模进攻。
天子震怒之下，即任命郭君镇为征虏大将军——这是顺朝最高军阶大将军的首次设置——从三边各地调集精兵，往青海讨伐固始汗。
随着大量顺军精兵抵达青海解围，原本跟随固始汗作战的青海蒙古诸部纷纷叛离，改投降顺朝。
次年，征虏大将军郭君镇命米剌印督精骑进至青海湖，击败了哈喇河畔的和硕特部驻军，使得顺军士气大为振奋。
郭君镇根据当时的形势，亲自进驻西宁，指挥部署。他从陕西、四川、甘肃、朔方等地调来大量旧部，先分兵于永昌隆吉河防守，以防止和硕特大军内犯；后驻兵于巴塘、里塘、黄胜关等处，截断固始汗入藏之路。